Askeri Veteriner Okulu, Padişah II’nci Mahmut’un emri ile 1842 yılında Mekteb-i Harbiye (Harp Okulu) bünyesinde “Baytar Zabitan Sınıfı” adıyla eğitim ve öğretim faaliyetleri başlamıştır.
Veteriner öğrenimi 1873 yılına kadar Harp Okulu bünyesinde yürütülmüş, 1877 yılında Askeri Tıp Okulu ile birlikte İstanbul Tedarik Bölge Başkanlığı binasına taşınmıştır.
1884 yılında Askeri Tıp Okulu bünyesinde “Baytar Ameliyat Mektebi” kurulmuştur.
1888 yılına kadar Askeri Tıp Okulu ile birlikte aynı bina içinde sivil ve askeri veterinerler öğrenime devam etmiştir. Daha sonra bu günkü Askeri Müze ve Kültür Sitesi Komutanlığındaki Harp Okuluna nakledilmiştir.
1909 yılına kadar Harp Okulunda devam eden eğitim öğretim faaliyetleri “Askeri Baytar Mektebi” adı altında kendi binasında başlamıştır.
1921 yılında sivil ve askeri veteriner okulları birleştirilerek “Baytar Mekteb-i Âlisi” adı altında Selimiye’deki binalarda eğitim-öğretime devam edilmiştir. 1928 yılında Baytar Mekteb–i Âlisi’nin adı, “Yüksek Baytar Mektebi” şeklinde değiştirilmiştir.
1933 yılında Yüksek Baytar Mektebinin adının değiştirilmesi ile Askeri Veteriner Tatbikat Okulu adıyla eğitim-öğretim faaliyetlerini sürdürmüştür.
Askeri Veteriner Tatbikat Okulu, 1946 yılında İstanbul’dan Ankara’ya nakledilmiş, 1949 yılında ise adı “Askeri Veteriner Akademi Komutanlığı” olmuştur.
1953 yılında Gemlik’te 1’nci Ordu Komutanlığına bağlı olarak teşkil edilen “Hayvan Deposu Komutanlığı“nın adı 1960 yılında “Kara Kuvvetleri Hayvan Deposu Komutanlığı” olarak değiştirilmiştir.
1969 yılında Askeri Veteriner Akademisi Komutanlığının kadrosu daraltılarak adı “Askeri Veteriner Okul Komutanlığı” olarak değiştirilmiştir.
1978’de Gemlik’e nakledilerek Askeri Veteriner Araştırma Enstitüsü ve Eğitim Merkezi Komutanlığı adını almıştır.
Askeri Veteriner Araştırma Enstitüsü ve Eğitim Merkezi Komutanlığının adı 1992 yılında Askeri Veteriner Okulu ve Eğitim Merkezi Komutanlığı olarak değiştirilmiştir. 2007 yılından itibaren K.K.EDOK Komutanlığına bağlı, TSK’da başta Gıda Kontrol Hizmetleri olmak üzere, Köpek, At Üretim ve Eğitimi faaliyetleri ile birlikte Veteriner Sınıfı ile ilgili bilimsel araştırmalar sürdürülmektedir.
Veteriner Hekim Subay olarak yetiştirilmek üzere temin edilen personele Veteriner Subay stajı, Veteriner Astsubay olarak yetiştirilmek üzere temin edilen personele ise Astsubay Temel Kursu verilmektedir.
Köpek eğiticisi ve kullanıcısı uzman erbaşlar/sözleşmeli erlere mayın, takip, arama kurtarma, bomba arama, keşif ve devriye köpeği eğitici ve kullanıcı personel eğitimleri verilmektedir.
Askeri Veteriner Okulu ve Eğitim Merkezi Komutanlığında; Türk Silahlı Kuvvetlerinin ihtiyacı olan atların üretimi ve 4 yaşına kadar eğitimi icra edilmektedir. Eğitimi tamamlanan atlar 4 yaşından itibaren Atlı Spor Eğitim Merkezi Komutanlığına sevk edilmektedir.